Ebola (SUDAN)

Antisense 1 Antisense 2
Accession / Gene Name Target Sequence Sequence Position Free Energy (Kcal/mol) Sequence Position Free Energy (Kcal/mol)
L ATGATGGCTACCCAACATACACAATATCCTGATGCAAGATTGTCTTCCCCAATTGTCTTAGACCAATGTG ACCTAGTGACAAGAGCATGTGGACTTTACTCTGAGTATTCGCTGAACCCTAAACTAAAGACATGCCGTTT ACCGAAACATATCTATAGATTAAAATATGACACTATTGTTTTACGATTTATTAGTGATGTCCCTGTAGCT ACAATCCCAATAGACTACATTGCTCCGATGTTAATAAATGTTCTGGCAGATAGTAAAAATGTACCATTGG AACCTCCCTGCTTGAGTTTCTTGGATGAAATAGTCAATTATACCGTGCAGGATGCAGCCTTCCTTAATTA TTACATGAATCAGATTAAAACACAGGAAGGAGTAATTACAGATCAATTAAAACAGAACATTCGTAGGGTC ATTCACAAAAACAGATATCTATCTGCTCTATTCTTCTGGCATGATCTTGCCATCCTCACCCGTCGAGGGA GAATGAACCGAGGAAATGTGCGCTCCACTTGGTTTGTAACGAATGAGGTTGTTGACATTCTAGGATATGG TGATTATATCTTCTGGAAGATCCCTATTGCTCTATTACCAATGAACACAGCTAATGTTCCACATGCATCA ACTGACTGGTACCAACCTAATATCTTCAAGGAGGCTATTCAAGGACACACACATATTATTTCAGTCTCTA CAGCCGAGGTCCTTATTATGTGTAAGGATCTTGTCACAAGTCGTTTTAATACCCTTCTGATTGCTGAGTT AGCCAGGTTGGAAGATCCAGTGTCTGCTGATTATCCACTAGTAGATAATATTCAATCTCTGTATAACGCA GGAGACTACCTGTTGTCCATATTGGGATCAGAGGGGTACAAAATAATCAAATATCTCGAACCTCTGTGTT TGGCTAAGATTCAACTATGTTCCCAATATACAGAACGAAAAGGGCGGTTTTTAACCCAGATGCATCTTGC 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VP24 ATGGCTAAAGCCACAGGCCGGTACAACTTGGTAACACCAAAACGGGAGCTAGAGCAAGGAGTTGTGTTTA GCGACCTATGCAACTTCCTAGTGACTCCAACTGTGCAAGGATGGAAGGTTTACTGGGCTGGACTTGAGTT TGATGTCAACCAAAAGGGTATTACCCTGTTAAATCGTCTTAAAGTGAATGATTTTGCTCCTGCATGGGCG ATGACCCGGAACCTCTTCCCACACTTGTTCAAAAACCAACAGTCTGAAGTCCAAACTCCCATTTGGGCCT TGAGGGTAATTCTTGCCGCCGGGATTCTTGACCAATTAATGGATCATTCCCTCATTGAGCCGCTATCAGG GGCCCTGAACCTAATTGCTGATTGGTTACTAACAACATCTACTAATCACTTCAACATGAGAACTCAACGA GTAAAGGACCAACTGAGCATGAGGATGTTATCTCTTATAAGGTCAAATATTATTAACTTTATAAATAAGC TCGAGACTCTTCATGTCGTTAATTACAAGGGACTTCTAAGCAGTGTTGAGATAGGAACACCAAGCTATGC AATCATCATTACCAGGACTAATATGGGTTATCTTGTCGAGGTTCAGGAACCAGATAAATCTGCGATGGAT ATACGACACCCTGGTCCTGTCAAATTCTCCTTACTACATGAATCGACACTTAAACCTGTTGCCACTCCTA AACCATCAAGCATTACTTCATTGATCATGGAGTTCAACAGTTCTTTGGCAATTTAA UUUGAUAACCUUAUCUCGC 95 -20.5 UAAACUAAGAUCAUACAGG 1300-1319 -19.3
NP ATGGATAAACGGGTGAGAGGTTCATGGGCCCTGGGAGGACAATCTGAAGTTGATCTTGACTACCACAAAA TATTAACAGCCGGGCTTTCGGTCCAACAAGGGATTGTGCGACAAAGAGTCATCCCGGTATATGTTGTGAG TGATCTTGAGGGTATTTGTCAACATATCATTCAGGCCTTTGAAGCAGGCGTAGATTTCCAAGATAATGCT GACAGCTTCCTTTTACTTTTATGTTTACATCATGCTTACCAAGGAGATCATAGGCTCTTCCTCAAAAGTG ATGCAGTTCAATACTTAGAGGGCCATGGTTTCAGGTTTGAGGTCCGAGAAAAGGAGAATGTGCACCGTCT GGATGAATTGTTGCCCAATGTCACCGGTGGAAAAAATCTTAGGAGAACATTGGCTGCAATGCCTGAAGAG GAGACAACAGAAGCTAATGCTGGTCAGTTTTTATCCTTTGCCAGTTTGTTTCTACCCAAACTTGTCGTTG GGGAGAAAGCGTGTCTGGAAAAAGTACAAAGGCAGATTCAGGTCCATGCAGAACAAGGGCTCATTCAATA TCCAACTTCCTGGCAATCAGTTGGACACATGATGGTGATCTTCCGTTTGATGAGAACAAACTTTTTAATC AAGTTCCTACTAATACATCAGGGGATGCACATGGTCGCAGGCCATGATGCGAATGACACAGTAATATCTA ATTCTGTTGCCCAAGCAAGGTTCTCTGGTCTTCTGATTGTAAAGACTGTTCTGGACCACATCCTACAAAA AACAGATCTTGGAGTACGACTTCATCCACTGGCCAGGACAGCAAAAGTCAAGAATGAGGTCAGTTCATTC AAGGCAGCTCTTGGCTCACTTGCCAAGCATGGAGAATATGCTCCATTTGCACGTCTCCTCAATCTTTCTG GAGTCAACAACTTGGAACATGGGCTTTATCCACAACTCTCAGCCATTGCTTTGGGTGTTGCAACTGCCCA CGGGAGCACGCTGGCTGGTGTTAATGTAGGGGAGCAATATCAGCAACTGCGTGAGGCTGCTACTGAAGCT GAAAAGCAACTCCAACAATATGCTGAAACACGTGAGTTGGACAACCTTGGGCTTGATGAACAGGAAAAGA AGATTCTCATGAGCTTCCACCAGAAGAAGAATGAGATCAGCTTCCAGCAAACTAACGCAATGGTAACCCT GAGGAAAGAGCGGCTGGCCAAACTGACCGAAGCCATCACGACTGCATCAAAGATCAAGGTTGGAGATCGT TATCCTGATGACAATGATATTCCATTTCCCGGGCCGATCTATGATGAAACCCACCCCAACCCTTCTGATG ATAATCCTGATGATTCACGTGATACAACTATCCCAGGTGGTGTTGTTGACCCGTATGATGATGAGAGTAA TAATTATCCTGACTACGAGGATTCGGCTGAAGGCACCACAGGAGATCTTGATCTCTTCAATTTGGACGAC GACGATGACGACAGCCAACCAGGACCACCAGACAGGGGGCAGAGCAAGGAAAGAGCGGCTCGGACACATG GCCTCCAAGATCCGACCTTGGACGGAGCGAAAAAGGTGCCGGAGTTGACCCCAGGTTCCCACCAACCAGG CAACCTCCACATCACCAAGCCGGGTTCAAACACCAACCAACCACAAGGCAATATGTCATCTACTCTCCAG AGTATGACCCCTATACAGGAAGAATCAGAGCCCGATGATCAGAAAGATGATGATGACGAGAGTCTCACAT CCCTTGACTCTGAAGGTGACGAAGATGTTGAGAGCGTATCAGGGGAGAACAACCCAACTGTAGCTCCACC AGCACCAGTCTACAAAGATACTGGAGTAGACACTAATCAGCAAAATGGACCAAGCAATGCTGTAGATGGT CAAGGTTCTGAAAGTGAAGCTCTCCCAATCAACCCCGAAAAGGGATCTGCACTGGAAGAAACATATTATC ATCTCCTAAAAACACAGGGTCCATTTGAGGCAATCAATTATTATCACCTAATGAGTGATGAGCCCATTGC TTTTAGCACTGAAAGTGGCAAGGAATATATCTTCCCAGATTCTCTTGAAGAAGCCTACCCGCCTTGGTTG AGTGAGAAGGAGGCCTTAGAGAAAGAAAATCGTTATCTGGTCATTGATGGCCAGCAATTCCTCTGGCCAG TAATGAGCCTACAGGACAAGTTCCTTGCTGTTCTTCAACATGACTGA UUACUCUCAUCAUCAUACG 1784 -23 UUUCAGCUUCAGUAGCAGC 1438-1459 -24.3
VP35 ATGCAGCAGGATAGGACTTATAGACATCATGGACCCGAAGTGTCTGGCTGGTTTTCTGAGCAATTAATGA CCGGCAAAATACCGCTAACAGAGGTGTTTGTTGATGTTGAAAACAAACCAAGTCCTGCCCCGATAACCAT TATTAGTAAGAATCCCAAGACAACACGTAAAAGTGATAAGCAAGTCCAAACAGATGATGCCAGTAGCTTA TTGACAGAAGAAGTCAAGGCTGCCATAAATTCGGTGATATCAGCTGTGCGTCGGCAAACCAATGCTATTG AATCACTAGAAGGTCGAGTAACAACTCTTGAGGCCAGCTTAAAACCCGTTCAAGACATGGCAAAGACCAT ATCATCCCTGAATCGCAGCTGTGCCGAAATGGTTGCAAAATACGACCTACTGGTGATGACCACTGGGCGA GCAACTGCCACTGCTGCAGCAACAGAAGCATATTGGAATGAACATGGACAAGCACCTCCAGGCCCATCAT TGTACGAGGATGATGCTATTAAGGCTAAATTGAAAGATCCGAACGGGAAGGTTCCAGAAAGTGTCAAACA GGCCTACATAAATCTAGATAGCACAAGTGCCCTCAATGAGGAAAATTTCGGGCGACCTTACATTTCAGCA AAAGATCTCAAGGAAATCATCTATGACCATCTCCCAGGATTTGGGACAGCTTTTCATCAGTTGGTGCAGG TTATCTGCAAAATTGGTAAGGATAATAATATCCTAGACATAATTCATGCAGAATTCCAAGCAAGCTTGGC TGAGGGAGACTCCCCCCAGTGTGCATTAATCCAGATAACAAAACGGATCCCTGCTTTCCAAGATGCCTCT CCTCCAATTGTGCATATCAAGTCTCGAGGAGATATACCCAAAGCCTGTCAGAAAAGCCTCCGGCCGGTCC CACCGTCACCAAAGATCGATAGAGGTTGGGTCTGTATTTTTCAATTCCAAGACGGGAAGGCCCTTGGGCT AAAAATATGA UUAAAACUGACUUAUAAGC 1207 -19.5 UUCAACAUCAACAAACACC 218-237 -15.6
VP40 ATGAGAAGGGTCACTGTGCCGACTGCACCACCTGCCTATGCTGACATTGGCTATCCTATGAGCATGCTTC CCATCAAGTCAAGCAGGGCTGTGAGTGGAATTCAACAGAAACAAGAGGTCCTTCCTGGAATGGATACACC ATCAAATTCTATGAGACCTGTTGCTGATGATAACATTGATCATACAAGTCATACCCCGAACGGAGTGGCC TCAGCATTCATCTTGGAGGCAACTGTCAATGTGATCTCGGGGCCCAAAGTCCTCATGAAACAAATCCCTA TTTGGTTGCCACTCGGAATTGCTGACCAAAAAACGTACAGTTTTGACTCAACAACAGCAGCAATTATGCT CGCATCTTATACGATCACCCATTTTGGAAAGGCCAACAACCCCCTCGTTAGAGTGAATCGACTTGGTCAG GGAATACCGGATCACCCACTCAGATTGCTCAGGATGGGGAACCAGGCTTTCCTTCAAGAGTTTGTGCTAC CACCAGTTCAACTGCCGCAATATTTCACTTTTGATCTGACTGCACTCAAACTAGTGACACAGCCTCTCCC TGCTGCAACATGGACAGATGAGACTCCGAGCAACCTTTCAGGAGCCCTTCGTCCCGGGCTTTCATTTCAC CCAAAGCTGAGACCCGTTCTACTTCCAGGCAAGACGGGAAAGAAAGGGCATGTTTCTGATCTGACTGCCC CAGACAAAATTCAGACAATTGTGAACCTGATGCAAGATTTCAAAATCGTGCCAATTGATCCAGCTAAGAG TATCATTGGGATCGAGGTTCCAGAATTGCTGGTCCACAAGCTCACTGGGAAGAAAATGAGTCAGAAGAAT GGACAGCCTATAATTCCTGTCTTACTCCCAAAATACATTGGGCTAGATCCAATCTCACCTGGAGACCTGA CTATGGTCATAACACCAGATTATGATGATTGTCATTCACCTGCCAGTTGCTCTTATCTCAGTGAAAAGTG A UUUUCACUGAGAUAAGAGC 1048 -21.3 UAUGAUCAAUGUUAUCAUC 255-274 -21.3
GP ATGGGGGGTCTTAGCCTACTCCAATTGCCCAGGGACAAATTTCGGAAAAGCTCTTTCTTTGTTTGGGTCA TCATCTTATTCCAAAAGGCCTTTTCCATGCCTTTGGGTGTTGTGACTAACAGCACTTTAGAAGTAACAGA GATTGACCAGCTAGTCTGCAAGGATCATCTTGCATCTACTGACCAGCTGAAATCAGTTGGTCTCAACCTC GAGGGGAGCGGAGTATCTACTGATATCCCATCTGCAACAAAGCGTTGGGGCTTCAGATCTGGTGTTCCTC CCAAGGTGGTCAGCTATGAAGCGGGAGAATGGGCTGAAAATTGCTACAATCTTGAAATAAAGAAGCCGGA CGGGAGCGAATGCTTACCCCCACCGCCAGATGGTGTCAGAGGCTTTCCAAGGTGCCGCTATGTTCACAAA GCCCAAGGAACCGGGCCCTGCCCAGGTGACTACGCCTTTCACAAGGATGGAGCTTTCTTCCTCTATGACA GGCTGGCTTCAACTGTAATTTACAGAGGAGTCAATTTTGCTGAGGGGGTAATTGCATTCTTGATATTGGC TAAACCAAAAGAAACGTTCCTTCAGTCACCCCCCATTCGAGAGGCAGTAAACTACACTGAAAATACATCA AGTTATTATGCCACATCCTACTTGGAGTATGAAATCGAAAATTTTGGTGCTCAACACTCCACGACCCTTT TCAAAATTGACAATAATACTTTTGTTCGTCTGGACAGGCCCCACACGCCTCAGTTCCTTTTCCAGCTGAA TGATACCATTCACCTTCACCAACAGTTGAGTAATACAACTGGGAGACTAATTTGGACACTAGATGCTAAT ATCAATGCTGATATTGGTGAATGGGCTTTTTGGGAAAATAAAAAATCTCTCCGAACAACTACGTGGAGAA GAGCTGTCTTTCGAAGCTTTATCGCTCAACGAGACAGAAGACGATGA UUUCAAGUAUCAGUAUCGG 2204 -23.5 UUAGUUUGUCUUCUGCUGC 1607-1630 -25.1
VP30 ATGGAGAGGGGTCGTGAGCGCGGGAGATCAAGGAATTCACGTGCCGACCAGCAAAATTCAACAGGTCCTC AATTTAGGACAAGATCCATTTCCCGGGATAAGACAACAACAGACTACCGTAGTAGTCGAAGTACTTCGCA AGTTAGAGTCCCTACGGTTTTCCATAAGAAAGGTACTGGGACCCTTACTGTCCCTCCAGCACCTAAGGAT GTTTGTCCTACTCTCAGAAAAGGATTTCTATGTGATAGTAATTTCTGTAAAAAGGACCATCAACTTGAAA GCCTAACCGACCGGGAGCTCCTACTTCTTATAGCACGGAAGACCTGTGGATCAACTGATTCATCGCTTAA TATAGCTGCTCCTAAAGACCTAAGACTAGCAAATCCTACGGCTGATGACTTCAAGCAAGACGGCAGTCCA AAATTAACCCTAAAATTACTAGTCGAGACTGCTGAGTTTTGGGCCAATCAGAATATTAATGAAGTAGATG ATGCAAAACTCCGTGCTCTCTTGACGTTGAGTGCTGTCTTAGTGCGGAAATTCTCTAAGTCACAGCTTAG TCAATTATGTGAGAGTCATCTTAGGAGGGAAAACTTAGGACAAGACCAAGCTGAATCAGTTCTCGAGGTT TATCAACGTTTACATAGTGACAAAGGAGGTGCTTTTGAGGCAGCACTATGGCAACAGTGGGATAGACAAT CATTAACTATGTTTATATCTGCTTTCCTCCATGTAGCATTGCAACTTTCCTGTGAGAGCTCCACTGTAGT GATATCAGGCCTACGCTTACTTGCCCCCCCAAGCGTTAATGAAGGGCTCCCTCCTGCACCAGGGGAATAT ACTTGGTCAGAAGATAGTACAACTTAG UACUAUCACAUAGAAAUCC 449 -22.9 UUACUAUCACAUAGAAAUC 450-471 -20.4