Ebola (BUNDIBUGYO)

Antisense 1 Antisense 2
Accession / Gene Name Target Sequence Sequence Position Free Energy (Kcal/mol) Sequence Position Free Energy (Kcal/mol)
L ATGGCAACTCAACATACACAATATCCAGATGCAAGATTATCTTCACCCATTGTCTTAGATCAATGTGATC TTGTCACCCGTGCTTGCGGTCTGTATTCTTCATACTCATTAAATCCTCAGTTGAAAAATTGTAGACTACC AAAACATATTTACCGCCTCAAATTTGATGCTACGGTTACAAAATTTTTAAGCGATGTTCCAATAGTTACA TTGCCGATAGATTACTTGACCCCTTTACTTTTACGAACTTTATCCGGGGAGGGCTTATGCCCTGTCGAAC CAAAGTGCAGCCAATTCTTAGATGAAATAGTAAGTTATGTTTTGCAGGATGCACGTTTTTTAAGATACTA TTTTAGGCATGTTGGAGTACACGATGACAATGTTGGAAAAAATTTTGAGCCAAAGATTAAGGCTTTGATT TATGATAATGAATTTCTGCAACAATTGTTTTATTGGTACGATTTAGCAATCCTAACGCGTAGAGGGCGCC TGAATCGAGGGAATAACCGTTCAACATGGTTTGCAAATGACGATTTAATAGACATTCTCGGGTACGGTGA TTATATTTTCTGGAAAATACCGTTGTCATTGTTGTCACTCAACACAGAGGGGATTCCTCATGCAGCTAAG GACTGGTATCACGCATCAATCTTCAAAGAAGCGGTTCAAGGTCACACACATATCGTGTCAGTTTCCACTG CAGATGTTTTAATTATGTGTAAGGACATCATAACCTGTCGTTTCAATACCACACTCATTGCAGCATTGGC AAATTTAGAAGATTCTATCTGTTCTGACTATCCACAACCTGAAACAATCTCTAATCTGTATAAGGCAGGG GATTACTTAATCTCGATACTGGGTTCAGAAGGTTATAAGGTCATAAAGTTTTTAGAACCACTATGTTTAG CTAAGATCCAATTGTGCTCAAATTACACTGAGAGGAAAGGGAGATTCCTTACTCAAATGCATTTGGCCGT TAATCACACACTTGAAGAACTTATTGAGGGCCGGGGATTGAAGTCACAACAAGACTGGAAGATGAGGGAA TTTCACCGAATCTTAGTAAATTTAAAGTCAACACCACAACAACTCTGTGAATTGTTTTCAGTGCAAAAGC ATTGGGGGCATCCTGTGCTACATAGCGAGAAGGCTATTCAGAAAGTAAAGAAACATGCAACCGTAATAAA AGCATTGCGTCCCGTAATCATCTTTGAGACATATTGTGTGTTCAAGTACAGCATTGCCAAACATTATTTT GATAGCCAAGGGTCATGGTATAGTGTAATCTCAGATAAACATCTAACACCAGGTTTACACTCTTACATTA AGAGGAACCAATTTCCGCCACTGCCTATGATTAAAGACTTATTGTGGGAATTCTATCACCTTGATCATCC TCCCTTATTTTCCACCAAGATTATTAGTGACTTGAGTATTTTCATTAAGGATCGCGCTACCGCAGTGGAA AAAACATGTTGGGATGCAGTTTTCGAGCCTAATGTTCTTGGATATAGTCCTCCAAACAAGTTCTCAACTA AGAGGGTTCCTGAACAGTTTCTTGAACAAGAAAATTTCTCGATTGATAGTGTTCTCACTTATGCCCAGCG CCTGGATTATCTACTTCCACAATACCGGAATTTTTCTTTCTCACTTAAGGAAAAAGAATTAAATGTAGGA CGAGCTTTTGGTAAGCTACCTTATCCTACACGTAATGTTCAAACTTTATGTGAAGCCTTATTGGCAGATG GATTAGCTAAAGCCTTTCCTAGTAACATGATGGTTGTAACAGAGCGTGAGCAGAAGGAAAGCCTCTTGCA CCAGGCGTCGTGGCACCACACAAGTGACGATTTCGGTGAGAATGCCACTGTTAGAGGCAGCAGTTTTGTT ACCGACCTAGAAAAATACAACTTGGCATTTAGATATGAGTTTACAGCTCCATTTATTGAATACTGTAATC 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ATTTCTTCCATGCATCACTTGCCTATTGGAGGAGCCGGCACAAAGGACGGCCCAAAAATCGATCGACCGA AGAACAGACAGTTAAACCCATACCATATGATAATTTTCATTCTGTTAAATGTGCCTCAAACCCACCAAGC ATCCCCAAATCTAAGTCAGGAACTCAAGGTTCAAGCGCATTTTTTGAGAAACTTGAATATGATAAAGAAA GAGAATTGCCAACAGCTTCCACACCAGCCGAACAATCCAAGACCTATATCAAGGCCCTATCCAGCCGAAT TTATCATGGTAAAACACCATCCAATGCCGCAAAAGATGATTCAACAACCTCCAAGGGCTGCGATTCCAAA GAAGAAAATGCCGTTCAAGCTTCACACCGAATTGTCCTACCATTTTTTACATTGTCACAGAACGACTACA GAACTCCCTCAGCTAAAAAGTCAGAGTATATAACTGAAATCACCAAACTAATTCGACAATTAAAGGCAAT TCCAGATACCACTGTATACTGTCGCTTTACAGGGGTTGTATCTTCAATGCATTATAAGCTTGATGAGGTT CTCTGGGAATTCGATAGTTTCAAAACTGCTGTGACTCTAGCTGAAGGAGAAGGGTCAGGTGCCTTATTAC TACTACAAAAATATAAGGTCAGAACAATCTTTTTTAACACTTTAGCTACAGAGCATAGCATCGAGGCAGA AATAGTTTCTGGGACAACCACACCTCGAATGCTCCTTCCTGTAATGGCCAAACTTCATGATGATCAAATA AATGTAATATTAAACAATTCTGCTAGCCAGGTTACTGATATCACTAACCCTGCATGGTTCACTGACCAGA AATCTAGAATCCCCACACAAGTTGAGATTATGACTATGGATGCTGAAACGACAGAAAATATTAATCGGTC AAAATTATATGAGGCTATTCAGCAATTAATTGTTTCACACATTGATACAAGGGTGCTAAAGATTGTTATT 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NP ATGGATCCTCGTCCAATCAGAACCTGGATGATGCATAACACATCTGAAGTTGAAGCAGACTACCATAAGA TTCTAACTGCCGGATTGTCCGTCCAGCAAGGCATTGTGAGACAAAGAATCATTCCTGTTTACCAAATCTC AAACCTGGAGGAAGTATGTCAACTCATCATACAGGCATTCGAGGCTGGCGTCGACTTCCAGGATAGTGCA GATAGCTTTTTGTTAATGCTATGTCTGCATCATGCCTATCAAGGGGATTATAAACAATTTTTGGAAAGTA ATGCGGTAAAATACCTTGAAGGTCATGGATTCCGTTTTGAGATGAAGAAAAAGGAAGGTGTCAAGCGCCT GGAGGAACTACTCCCTGCTGCCTCGAGTGGAAAGAACATCAAGAGAACATTGGCTGCAATGCCCGAGGAG GAAACAACAGAAGCAAATGCTGGACAATTTCTTTCATTTGCTAGTCTGTTTCTCCCAAAATTGGTTGTCG GAGAAAAGGCCTGTCTGGAGAAGGTTCAACGACAAATCCAAGTGCACGCAGAACAAGGTCTGATTCAATA CCCGACATCTTGGCAATCGGTGGGACATATGATGGTCATCTTCAGACTAATGCGAACCAACTTCCTGATT AAGTTCCTCCTAATACATCAAGGAATGCATATGGTTGCAGGGCATGATGCTAATGATGCCGTCATTGCCA ACTCTGTAGCTCAAGCTCGTTTCTCCGGATTGTTGATAGTCAAAACAGTGCTTGATCATATCCTCCAAAA AACAGAGCACGGAGTTCGCCTGCATCCCTTGGCGCGAACAGCCAAAGTCAAAAATGAGGTGAGCTCTTTT AAGGCCGCTTTAGCCTCACTAGCACAACATGGAGAATATGCCCCGTTTGCTCGTCTGCTGAATCTATCTG GGGTTAATAATCTTGAGCATGGGCTTTTCCCTCAACTTTCTGCAATTGCTTTGGGAGTAGCAACTGCACA TGGGAGCACTCTGGCTGGAGTCAATGTAGGAGAGCAATACCAACAACTGCGAGAAGCAGCCACTGAGGCC GAAAAGCAGTTGCAGAAATATGCTGAATCTCGTGAACTTGATCACCTAGGTCTTGATGATCAGGAAAAGA AAATCCTAAAAGACTTCCATCAGAAAAAGAATGAGATCAGCTTCCAGCAGACGACAGCCATGGTCACACT GCGGAAAGAGAGATTGGCCAAATTGACCGAAGCTATTACTTCCACCTCTATCCTCAAAACAGGAAGGCGG TATGATGATGACAATGACATACCCTTTCCAGGGCCAATCAATGATAACGAGAACTCTGGTCAGAACGATG ACGATCCAACAGACTCCCAGGATACCACAATCCCGGATGTAATAATCGATCCAAACGATGGTGGGTATAA TAATTACAGCGATTATGCAAATGATGCTGCAAGTGCTCCTGATGACCTAGTTCTTTTTGACCTTGAGGAC GAGGATGATGCTGATAACCCGGCTCAAAACACGCCAGAAAAAAATGATAGACCAGCAACAACAAAGCTGA GAAATGGACAGGACCAGGATGGAAACCAAGGCGAAACTGCATCCCCACGGGTAGCCCCCAACCAATACAG AGACAAGCCAATGCCACAAGTACAGGACAGATCCGAAAATCATGACCAAACCCTTCAAACACAGTCCAGG GTTTTGACTCCTATCAGCGAGGAAGCAGACCCCAGCGACCACAACGATGGTGACAATGAAAGCATTCCTC CCCTGGAATCAGACGACGAGGGTAGCACTGATACTACTGCAGCAGAAACAAAGCCTGCCACTGCACCTCC CGCTCCCGTCTACCGAAGTATCTCCGTAGATGATTCTGTCCCCTCAGAGAACATTCCCGCACAGTCCAAT CAAACGAACAATGAGGACAATGTCAGGAACAATGCTCAGTCGGAGCAATCCATTGCAGAAATGTATCAAC ATATCTTGAAAACACAAGGACCTTTTGATGCCATCCTTTACTACCATATGATGAAAGAAGAGCCCATCAT TTTCAGCACTAGTGATGGGAAGGAGTATACATATCCAGACTCTCTTGAAGATGAGTATCCACCCTGGCTC AGCGAGAAGGAAGCCATGAACGAAGACAATAGATTCATAACCATGGATGGTCAGCAGTTTTACTGGCCTG TGATGAATCATAGAAATAAATTCATGGCAATCCTCCAGCATCACAGGTGA UUUCUUCAUCUCAAAACGG 714 -21.2 UUAACAAAAAGCUAUCUGC 610-629 -16.4
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GP ATGGTTACATCAGGAATTCTACAATTGCCCCGTGAACGCTTCAGAAAAACATCATTTTTTGTTTGGGTAA TAATCCTATTTCACAAAGTTTTCCCTATCCCATTGGGCGTAGTTCACAACAACACTCTCCAGGTAAGTGA TATAGATAAATTGGTGTGCCGGGATAAACTTTCCTCCACAAGTCAGCTGAAATCGGTCGGGCTTAATCTA GAAGGTAATGGAGTTGCCACAGATGTACCAACAGCAACGAAGAGATGGGGATTCCGAGCTGGTGTTCCAC CCAAAGTGGTGAACTACGAAGCTGGGGAGTGGGCTGAAAACTGCTACAACCTGGACATCAAGAAAGCAGA TGGTAGCGAATGCCTACCTGAAGCCCCTGAGGGTGTAAGAGGCTTCCCTCGCTGCCGTTATGTGCACAAG GTTTCTGGAACAGGGCCGTGCCCTGAAGGTTACGCTTTCCACAAAGAAGGCGCTTTCTTCCTGTATGATC GACTGGCATCAACAATCATCTATCGAAGCACCACGTTTTCAGAAGGTGTTGTGGCTTTCTTGATCCTCCC CGAAACTAAAAAGGACTTTTTCCAATCGCCACCACTACATGAACCGGCCAATATGACAACAGACCCATCC AGCTACTACCACACAGTCACACTTAATTATGTGGCTGACAATTTTGGGACCAATATGACTAACTTTCTGT TTCAAGTGGATCATCTAACTTATGTGCAACTTGAACCAAGATTCACACCACAATTTCTTGTCCAACTCAA TGAGACCATTTATACTAATGGGCGTCGCAGCAACACCACAGGAACACTAATTTGGAAAGTAAATCCTACT GTTGACACCGGCGTAGGTGAATGGGCCTTCTGGGAAAATAAAAAACTTCACAAAAACCCTTTCAAGTGA UUUAUCUAUAUCACUUACC 271 -21.6 UUACAGUACAAACUUAGUC 2356-2377 -21.6
VP30 ATGGACTCATTTCATGAGAGAGGGCGTAGCAGAACTATTCGACAGAGTGCAAGAGATGGGCCGAGTCATC AAGTAAGAACAAGATCATCCTCCAGAGACAGCCACCGCAGCGAATATCATACACCTAGGAGCTCTTCCCA AGTTCGAGTCCCGACTGTGTTTCATCGGAAGCGTACTGATTCTTTGACAGTTCCACCAGCACCAAAGGAC ATATGTCCTACCTTAAGGAAAGGATTTTTGTGTGACAGCAATTTTTGTAAAAAGGACCATCAACTAGAAA GTTTAACAGATAGGGAGCTGCTTTTGCTGATTGCACGGAAAACCTGCGGCTCCCTTGAACAACAATTGAA CATCACTGCTCCTAAAGATACACGATTAGCAAATCCAATTGCAGATGATTTCCAACAAAAAGACGGCCCA AAAATTACACTATTGACACTTTTGGAGACTGCGGAGTATTGGTCAAAACAAGATATCAAGGGCATTGATG ACTCAAGACTAAGAGCATTACTAACCCTTTGTGCCGTCATGACGAGGAAATTCTCAAAATCCCAGCTTAG TCTATTGTGTGAGAGTCATCTACGACGAGAAGGGCTAGGACAGGATCAATCAGAATCTGTTCTTGAAGTG TATCAGCGCTTACATAGCGACAAAGGCGGAAATTTTGAGGCAGCCCTATGGCAACAATGGGACCGACAGT CCTTGATCATGTTTATAACAGCATTTCTTAATATTGCTTTACAATTACCCTGTGAAAGTTCATCTGTTGT TATTTCAGGATTAAGGCTGCTAGTGCCTCAATCAGAAGATACCGAGACCTCAACCTACACCGAGACACGT GCATGGTCAGAGGAAGGTGGCCCCCATTAA UAGUAAAUAUGUAAAUAGC 136 -19.2 UUGCUGUCACACAAAAAUC 460-481 -20.1